В рамках виконання Указу Президента Киргизької Республіки щодо боротьби з корупцією та підвищення ефективності державної служби, Національне агентство з інвестицій при Президентові Киргизької Республіки проводить заходи, спрямовані на забезпечення прозорості діяльності, зміцнення виконавчого порядку, підвищення відповідальності державних службовців, а також вдосконалення механізмів взаємодії з громадянами та представниками бізнесу на постійній основі.
Національне агентство з інвестицій при Президентові Киргизької Республіки регулярно проводить зустрічі з громадянами та представниками бізнесу. Ці зустрічі організовуються на основі взаємодії з державними та муніципальними органами, спрямовані на обговорення інвестиційних ініціатив у регіонах, а також на оперативне вирішення актуальних питань.
У межах своїх повноважень Національне агентство розглядає пропозиції, заяви та звернення громадян відповідно до законодавства Киргизької Республіки та вживає відповідних заходів. Електронні звернення також приймаються та розглядаються у встановленому порядку.
Для своєчасного реагування на звернення громадян в Національному агентстві затверджено графік особистого прийому громадян керівництвом, а також працює «телефон довіри» 300367. Крім того, з метою зміцнення зв'язків з населенням, Громадська приймальня працює на постійній основі.
Також, для оперативного збору думок та пропозицій громадян, Національне агентство підключено до автоматизованої інформаційної системи «Відгуки» та встановлено спеціальний QR-код. Через цю систему громадяни можуть залишати свої пропозиції та оцінювати діяльність відомства.
У Національному агентстві постійно проводяться заходи щодо зміцнення виконавчого порядку та підвищення службової відповідальності. У разі порушення термінів виконання документів проводяться службові розслідування, за результатами яких вживаються відповідні дисциплінарні заходи.